Η Μαρία Προγουλάκη είναι εξωτερική συνεργάτης στο Τμήμα Ναυτιλίας και Επιχειρηματικών Υπηρεσιών, στα μαθήματα προπτυχιακού και μεταπτυχιακού προγράμματος ‘Διοίκηση Ανθρώπινων Πόρων’, ‘Διοίκηση Ναυτιλιακών Επιχειρήσεων’ και ‘Στρατηγική των Επιχειρήσεων’ (2002-2007). Επίσης, συνεργάζεται με την εταιρεία K.C. Lyrintzis, Quality Maritime Services Training Center για την εκπαίδευση ναυτιλιακών στελεχών στο αντικείμενο “Human Resource Management in Shipping”. Έχει υπάρξει υπότροφος του Ιδρύματος Προποντίς (2004-2006), και του Ευρωπαϊκού Προγράμματος Ενίσχυσης Ερευνητικού Δυναμικού- ΠΕΝΕΔ 2003- «Στρατηγικές Ελληνικής Ναυτιλίας σε Συνθήκες Ανταγωνισμού: Επιχειρηματικές και Λειτουργικές Πρακτικές για Διαμόρφωση Συνθηκών Ανταγωνισμού και Ανταγωνιστικότητας» (2005-2008). Επίσης, έχει λάβει βραβεία από το Propeller Club of the United States (2002), τη ναυτιλιακή εταιρεία Naftotrade (2001) και το πρόγραμμα URIT (2001).